1)生物有機肥營養元素齊全;化肥營養元素只有一種或幾種。

　　2)生物有機肥能夠改良土壤;化肥經常使用會造成土壤板結。

　　3)生物有機肥能提高產品品質;化肥施用過多導致產品品質低劣。

　　4)生物有機肥能改善作物根際微生物群，提高植物的抗病蟲能力;化肥則是作物微生物群體單一，易發生病蟲害。

　　5)生物有機肥能促進化肥的利用，提高化肥利用率;化肥單獨使用易造成養分的固定和流失。